Wydany w Japonii w 1979 roku, ten sportowy, ale delikatny model z czterema zaworami DOHC na cylinder generował zdrowe 44 KM przy 9500 obr / min, a ważąc stosunkowo smukłe 175 kg był dość szybki jak na ówczesne standardy. Był stylizowany podobnie do swojego kolegi ze stajni GSX250E, a oba modele zostały wprowadzone na rynek europejski w 1980 roku. Ten GSX400E zastąpił stary model GS425 z dwoma zaworami na cylinder. Silnik działał dobrze jako 250, ale w formie 400 był zbyt rozciągnięty, a jego słaba reputacja w zakresie niezawodności sprawiła, że nie był popularny w Europie. Zupełnie inny GSX400F (Four) został wydany w 1981 roku, również z czterozaworową głowicą.
