Dit sportieve maar kwetsbare DOHC vierkleppers per cilinder model werd in 1979 uitgebracht in Japan en produceerde een gezonde 44 pk bij 9500 tpm en met een gewicht van 175 kg was hij behoorlijk snel voor de normen van die tijd. Hij had hetzelfde design als zijn GSX250E stalgenoot en beide modellen werden in 1980 in Europa gelanceerd. Deze GSX400E verving het oude GS425 model met twee kleppen per cilinder. De motor werkte prima als 250, maar in zijn 400 vorm was hij te uitgerekt en zijn slechte reputatie op het gebied van betrouwbaarheid maakte hem niet populair in Europa. Een totaal andere GSX400F (Four) werd uitgebracht in 1981, ook met een vierkleps kop.
