Uscito in Giappone nel 1979, questo sportivo ma fragile modello DOHC a quattro valvole per cilindro sprigionava un'ottima potenza di 44 CV a 9500 giri/min, e con un peso relativamente contenuto di 175 kg era piuttosto veloce per gli standard dell'epoca. Il suo stile era simile a quello della compagna di scuderia GSX250E ed entrambi i modelli furono lanciati in Europa nel 1980. La GSX400E sostituiva il vecchio modello GS425 a due valvole per cilindro. Il motore funzionava bene come 250, ma nella versione 400 era eccessivamente allungato e la sua scarsa reputazione in termini di affidabilità lo rese impopolare in Europa. Nel 1981 uscì una GSX400F (Four) completamente diversa, anch'essa con una testa a quattro valvole.
