Commercialisé au Japon en 1979, ce modèle sportif mais fragile à double arbre à cames en tête et quatre soupapes par cylindre développait une puissance de 44 ch à 9500 tr/min et, avec un poids relativement léger de 175 kg, il était plutôt rapide selon les normes de l'époque. Son style était similaire à celui de sa compagne GSX250E, et les deux modèles ont été lancés en Europe en 1980. Cette GSX400E remplaçait l'ancien modèle GS425 à deux soupapes par cylindre. Le moteur fonctionnait bien en 250, mais sous sa forme 400, il était trop étiré et sa mauvaise réputation en matière de fiabilité l'a rendu impopulaire en Europe. Une GSX400F (Four) totalement différente a été commercialisée en 1981, également avec une culasse à quatre soupapes.
