Tras la exitosa CR80, la CR85 fue anunciada en 2003, y el diseño tuvo en cuenta el hecho de que los jóvenes eran cada vez más grandes y altos para su edad, por lo que con grandes ruedas y otras modificaciones la CR85 pronto alcanzó el dominio que una vez tuvo la CR80. Para el modelo de 2006, así es como Honda America presentó el modelo: "¿Quieres ganar en serio? Entonces empieza a correr con la moto que domina totalmente la competición: la CR85R. Construida con toda la atención al detalle y la ingeniería avanzada de sus hermanas mayores CR/CRF, no hay ninguna otra moto en el mercado que se le pueda comparar".