Dieses sportliche, aber anfällige DOHC-Modell mit vier Ventilen pro Zylinder, das 1979 in Japan auf den Markt kam, leistete gesunde 44 PS bei 9500 U/min und war mit seinen relativ schlanken 175 kg für damalige Verhältnisse ziemlich schnell. Das Design ähnelte dem der GSX250E, und beide Modelle wurden 1980 in Europa eingeführt. Diese GSX400E ersetzte das alte GS425-Modell mit zwei Ventilen pro Zylinder. Der Motor funktionierte gut als 250er, aber in seiner 400er-Form war er überfordert, und sein schlechter Ruf in Bezug auf Zuverlässigkeit machte ihn in Europa unbeliebt. 1981 wurde eine völlig andere GSX400F (Four) herausgebracht, ebenfalls mit einem Vierventilkopf.
